Los procedimientos de control de la calidad del Programa de Doctorado Interuniversitario en Equidad e Innovación en Educación dependen del Sistema de Garantía Interna de Calidad (SGIC) de la Escuela de Doctorado de la Universidad de Vigo, a la que el Programa está adscrito.

Las Escuelas de Doctorado (ED) son centros universitarios creados según el marco normativo del RD 99/2011, con el objeto de organizar los estudios y actividades propias de doctorado; en el caso de las universidades públicas gallegas, fueron creadas a través del Decreto 95/2013, de 13 de junio, de la Consellería de Cultura, Educación y Ordenación Universitaria.

El Protocolo de control de la calidad de la ED de la Universidad de Vigo está, actualmente, en fase de elaboración y deberá basarse, en todo caso, en el sistema marco de garantía de calidad de la Universidad de Vigo y fundamentarse y organizarse según las directrices marcadas por el RD 99/2011 para los Programas de doctorado.